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Python生物信息学数据管理/生命科学与信息技术丛书 - Softcover

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9787121303821: Python生物信息学数据管理/生命科学与信息技术丛书

Synopsis

本书实例意在解决生物学问题,通过“编程技法”的形式,涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都会有为生物研究者设计的编程题目,适合教学和自学。本书由六部分组成:Python语言基本介绍,语言所有成分介绍,高级编程,数据可视化,生物信息通用包Biopython,最后给出20个"编程秘笈”,范围涵盖了从二级结构预测、多序列比对到蛋白质三维结构的广泛话题。此外,本书附录还包括了大量的生物信息常用资源的信息。生命科学学院的Python课程教材,适合本科教学或行业人士的Python短期培训。第一部分入门第1章Pythonshell1.1本章知识点1.2案例:计算ATP水解的ΔG1.2.1问题描述1.2.2Python会话示例1.3命令的含义1.3.1如何在电脑上运行这个例子1.3.2变量1.3.3导入模块1.3.4计算1.4示例1.5自测题第2章第一个Python程序2.1本章知识点2.2案例:如何计算胰岛素序列中的氨基酸频率2.2.1问题描述2.2.2Python会话示例2.3命令的含义2.3.1如何执行程序2.3.2程序如何工作2.3.3注释2.3.4字符串变量2.3.5用for进行循环2.3.6缩进2.3.7打印至屏幕2.4示例2.5自测题第一部分小结第二部分数据管理第3章分析数据列3.1本章知识点3.2案例:树突长度3.2.1问题描述3.2.2Python会话示例3.3命令的含义3.3.1读取文本文件3.3.2写入文本文件3.3.3将数据收入列表3.3.4将文本转换为数字3.3.5将数字转换为文本3.3.6将数据列写入文本文件3.3.7计算数值列表3.4示例3.5自测题第4章解析数据记录4.1本章知识点4.2案例:整合质谱数据,转化到代谢通路中4.2.1问题描述4.2.2Python会话示例4.3命令的含义4.3.1if/elif/else语句4.3.2列表数据结构4.3.3简洁列表创建方式4.4示例4.5自测题第5章搜索数据5.1本章知识点5.2案例:将RNA序列翻译为相应的蛋白质序列5.2.1问题描述5.2.2Python会话示例5.3命令的含义5.3.1字典5.3.2while语句5.3.3用while循环搜索5.3.4字典搜索5.3.5列表搜索5.4示例5.5自测题第6章过滤数据6.1本章知识点6.2案例:使用RNA?seq输出数据6.2.1问题描述6.2.2Python会话示例6.3命令的含义6.3.1用简单的for...if组合过滤6.3.2合并两个数据集6.3.3两组数据之间的差异6.3.4从列表、字典和文件中删除元素6.3.5保持或不保持顺序地删除重复6.3.6集合6.4示例6.5自测题第7章管理表数据7.1本章知识点7.2案例:确定蛋白浓度7.2.1问题描述7.2.2Python会话示例7.3命令的含义7.3.1二维表的表示方法7.3.2访问行和单元格7.3.3插入和删除行7.3.4访问列7.3.5插入和删除列7.4示例7.5自测题第8章数据排序8.1本章知识点8.2案例:数据表排序8.2.1问题描述8.2.2Python会话示例8.3命令的含义8.3.1Python列表有利于排序8.3.

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