Interaktionsanalyse von Brix, einem Protein von Xenopus laevis, das in der Ribosomenbiogenese involviert ist

Georg Brunauer

ISBN 10: 3838684486 / ISBN 13: 9783838684482

Published by Diplom.De Nov 2004, 2004

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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -Diplomarbeit aus dem Jahr 2001 im Fachbereich Biologie - Genetik / Gentechnologie, Note: 1,0, Universität Salzburg (Naturwissenschaften), Sprache: Deutsch, Abstract: Inhaltsangabe:Zusammenfassung:In dieser Arbeit wird ein Protein behandelt, dessen cDNA aus Xenopus laevis kloniert wurde und den Namen Brix trägt. Diese cDNA codiert für ein potentielles Polypeptid mit 339 Aminosäuren (Genbank Accession: AF319877). In den Genomen von Mensch, C.elegans, Hefe und Arabidopsis thaliana existieren hoch homologe ORFs.Das Brix Protein lokalisiert im Nukleolus und den Cajal Bodies und interagiert mit 5S, 5,8S und 28S rRNA. In Saccharomyces cerevisiae codiert YOL077c (bzw. BRXl) für das Brix Homolog. YOL077c ist essentiell für das Wachstum der Zellen und lokalisiert ebenfalls im Nucleolus. Eine Expressionsverminderung von Brx1p inhibiert die Synthese der 60S ribosomalen Untereinheit und die Prozessierung der 35S prä- rRNA.Ziel dieser Arbeit war es, Interaktionspartner von Brix mit Hilfe des Yeast Two- Hybrid Systems zu finden. Die Art dieser Interaktionspartner liefert Hinweise auf die zellulären Abläufe, in denen Brix involviert ist.5 bekannte Proteine konnten als Two- Hybrid- Interaktionspartner identifiziert werden.Alle Two- Hybrid- Interaktionspartner unterstützen die bisher experimentell gewonnenen Hinweise auf eine direkte Beteiligung von Brix in der Ribosomenbiogenese und weisen auf eine Beteiligung von Brix sowohl in prä- rRNA Reifung und Ribosomenzusammenbau, als auch in Splicing und Modifikationen anderer RNAs hin.Inhaltsverzeichnis:Inhaltsverzeichnis:1.Einleitung32.Aufgabenstellung153.Material173.1Bakterienstämme173.2Hefestämme173.3Vektoren183.3.1Two- Hybrid- Vektoren183.3.2Matchmaker cDNA- Bank für Two- Hybrid- Screen193.3.3Reporterplasmid p8op-lacZ203.4Oligonucleotide für PCR und Sequenzierreaktionen213.5Chemikalien und Enzyme214.MEDIEN224.1Hefemedien224.1.1Medien generell224.1.2Medien für Two-Hybrid-Screen244.2Bakterienmedien255.METHODEN275.1Herstellung chemisch kompetenter E. coli275.2DNA- Präparationsmethoden285.2.1Plasmidisolierung aus E. coli: (Miniprep)285.2.2Plasmidisolierung aus Saccharomyces cerevisiae durch Sphäroplastierung305.3Polymerasekettenreaktion (PCR)315.4Klonierungsmethoden325.4.1Restriktionen325.4.2DNA-Gelelektrophorese335.4.3Elution von DNA aus Agarosegelstücken335.4.4Ligationen345.5Transformationsmethoden345.5.1Transformation von E. coli345.5.2Transformation von Saccharomyces cerevisiae355.6DNA- Sequenzierung365.7Two- Hybrid- Analyse375.7.1LexA- Two- Hybrid Transformation375.7.1.1Einfrieren der vermehrten Transformanten415.7.2Screening der Library Cotransformanten auf Two- Hybrid Interaktionen425.7.3Eliminierung falsch- positiver Klone445.7.3.1Screen nach Reporteraktivierung ohne Galaktoseinduktion des Prey445.7.3.2Plasmidverlusttest455.8Rescue positiver Library- Plasmide via Transformation in E. coli KC8455.9Retransformation in den Reporterstamm465.10Sequenzierung und Charakterisierung der Insertsequenz466.ERGEBNISSE UND DISKUSSION476.1Klonierung von BRIX476.2Überprüfung der Hintergrundaktivierung durch die LexA-Brix-Fusion im Reporterstamm, EGY 48[p8op-LacZ]486.3Two-Hybrid-Analyse496.3.1Prinzip und Schema der Methode496.3.2Screen nach Interaktionen zwischen Bait und Prey566.3.3Verifikation der Interaktionen586.3.3.1Reporteraktivierung ohne Galaktoseinduktion des Prey586.3.3.2Plasmidverlusttest586.4Rescue des Library-Plasmids596.5Retransformation der Plasmide in den Reporterstamm596.6Bestimmung der Interaktionspartner durch Sequenzierung und Daten. 96 pp. Deutsch.

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Bibliographic Details

• Title: Interaktionsanalyse von Brix, einem Protein von Xenopus laevis, das in der Ribosomenbiogenese involviert ist
• Publisher: Diplom.De Nov 2004
• Publication Date: 2004
• Language: German
• ISBN 10: 3838684486
• ISBN 13: 9783838684482
• Binding: Taschenbuch
• Condition: Neu
• Dimensions: 210W x 148H x 8D millimeters 210 millimeters width by 148 millimeters height by 8 millimeters depth
• Weight: 152 grams

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Synopsis

Diplomarbeit, die am 17.05.2001 erfolgreich an einer Universität in Österreich im Fachbereich Naturwissenschaften eingereicht wurde. Zusammenfassung: In dieser Arbeit wird ein Protein behandelt, dessen cDNA aus Xenopus laevis kloniert wurde und den Namen Brix trägt. Diese cDNA codiert für ein potentielles Polypeptid mit 339 Aminosäuren (Genbank Accession: AF319877). In den Genomen von Mensch, C.elegans, Hefe und Arabidopsis thaliana existieren hoch homologe ORFs. Das Brix Protein lokalisiert im Nukleolus und den Cajal Bodies und interagiert mit 5S, 5,8S und 28S rRNA. In Saccharomyces cerevisiae codiert YOL077c (bzw. BRXl) für das Brix Homolog. YOL077c ist essentiell für das Wachstum der Zellen und lokalisiert ebenfalls im Nucleolus. Eine Expressionsverminderung von Brx1p inhibiert die Synthese der 60S ribosomalen Untereinheit und die Prozessierung der 35S prä- rRNA. Ziel dieser Arbeit war es, Interaktionspartner von Brix mit Hilfe des Yeast Two- Hybrid Systems zu finden. Die Art dieser Interaktionspartner liefert Hinweise auf die zellulären Abläufe, in denen Brix involviert ist. 5 bekannte Proteine konnten als Two- Hybrid- Interaktionspartner identifiziert werden. Alle Two- Hybrid- Interaktionspartner unterstützen die bisher experimentell gewonnenen Hinweise auf eine direkte Beteiligung von Brix in der Ribosomenbiogenese und weisen auf eine Beteiligung von Brix sowohl in prä- rRNA Reifung und Ribosomenzusammenbau, als auch in Splicing und Modifikationen anderer RNAs hin. Inhaltsverzeichnis: 1.|Einleitung|3 2.|Aufgabenstellung|15 3.|Material|17 3.1|Bakterienstämme|17 3.2|Hefestämme|17 3.3|Vektoren|18 3.3.1|Two- Hybrid- Vektoren|18 3.3.2|Matchmaker cDNA- Bank für Two- Hybrid- Screen|19 3.3.3|Reporterplasmid p8op-lacZ|20 3.4|Oligonucleotide für PCR und Sequenzierreaktionen|21 3.5|Chemikalien und Enzyme|21 4.|MEDIEN|22 4.1|Hefemedien|22 4.1.1|Medien generell|22 4.1.2|Medien für Two-Hybrid-Screen|24 4.2|Bakterienmedien