Multiple Aspects of DNA and Rna: From Biophysics to Bioinformatics
Language: English
Published by Elsevier Science Nov 2005, 2005
- Hardcover
- New

Seller: BuchWeltWeit Ludwig Meier e.K., Bergisch Gladbach, GermanyBuchWeltWeit Ludwig Meier e.K.
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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -This book is dedicated to the multiple aspects, that is, biological, physical and computational of DNA and RNA molecules. These molecules, central to vital processes, have been experimentally studied by molecular biologists for five decades since the discovery of the structure of DNA by Watson and Crick in 1953. Recent progresses (e.g. use of DNA chips, manipulations at the single molecule level, availability of huge genomic databases.) have revealed an imperious need for theoretical modelling. Further progresses will clearly not be possible without an integrated understanding of all DNA and RNA aspects and studies.The book is intended to be a desktop reference for advanced graduate students or young researchers willing to acquire a broad interdisciplinary understanding of the multiple aspects of DNA and RNA. It is divided in three main sections:The first section comprises an introduction to biochemistry and biology of nucleic acids. The structure and function of DNA are reviewed in R. Lavery's chapter. The next contribution, by V. Fritsch and E. Westhof, concentrates on the folding properties of RNA molecules. The cellular processes involving these molecules are reviewed by J. Kadonaga, with special emphasis on the regulation of transcription. These chapters does not require any preliminary knowledge in the field (except that of elementary biology and chemistry).The second section covers the biophysics of DNA and RNA, starting with basics in polymer physics in the contribution by R. Khokhlov. A large space is then devoted to the presentation of recent experimental and theoretical progresses in the field of single molecule studies. T. Strick's contribution presents a detailed description of the various micro-manipulation techniques, and reviews recent experiments on the interactions between DNA and proteins (helicases, topoisomerases, .). The theoretical modeling of single molecules is presented by J. Marko, with a special attention paid to the elastic and topological properties of DNA. Finally, advances in the understanding of electrophoresis, a technique of crucial importance in everyday molecular biology, are exposed in T. Duke's contribution.The third section presents provides an overview of the main computational approaches to integrate, analyse and simulate molecular and genetic networks. First, J. van Helden introduces a series of statistical and computational methods allowing the identification of short nucleic fragments putatively involved in the regulation of gene expression from sets of promoter sequences controlling co-expressed genes. Next, the chapter by Samsonova et al. connects this issue of transcriptional regulation with that of the control of cell differentiation and pattern formation during embryonic development. Finally, H. de Jong and D. Thieffry review a series of mathematical approaches to model the dynamical behaviour of complex genetic regulatory networks. This contribution includes brief descriptions and references to successful applications of these approaches, including the work of B. Novak, on the dynamical modelling of cell cycle in different model organisms, from yeast to mammals. 378 pp. Englisch.…
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- Title
- Multiple Aspects of DNA and Rna: From Biophysics to Bioinformatics
- Publisher
- Elsevier Science Nov 2005
- Publication year
- 2005
- Condition
- Neu
- Binding
- Buch
- Language
- English
- ISBN 10
- 0444520813
- ISBN 13
- 9780444520814
- Item weight
- 721 grams
- Dimensions
- 234x161x20 mm
The book is intended to be a desktop reference for advanced graduate students or young researchers willing to acquire a broad interdisciplinary understanding of the multiple aspects of DNA and RNA. It is divided in three main sections:
The first section comprises an introduction to biochemistry and biology of nucleic acids. The structure and function of DNA are reviewed in R. Lavery's chapter. The next contribution, by V. Fritsch and E. Westhof, concentrates on the folding properties of RNA molecules. The cellular processes involving these molecules are reviewed by J. Kadonaga, with special emphasis on the regulation of transcription. These chapters does not require any preliminary knowledge in the field (except that of elementary biology and chemistry).
The second section covers the biophysics of DNA and RNA, starting with basics in polymer physics in the contribution by R. Khokhlov. A large space is then devoted to the presentation of recent experimental and theoretical progresses in the field of single molecule studies. T. Strick's contribution presents a detailed description of the various micro-manipulation techniques, and reviews recent experiments on the interactions between DNA and proteins (helicases, topoisomerases, ...). The theoretical modeling of single molecules is presented by J. Marko, with a special attention paid to the elastic and topological properties of DNA. Finally, advances in the understanding of electrophoresis, a technique of crucial importance in everyday molecular biology, are exposed in T. Duke's contribution.
The third section presents provides an overview of the main computational approaches to integrate, analyse and simulate molecular and genetic networks. First, J. van Helden introduces a series of statistical and computational methods allowing the identification of short nucleic fragments putatively involved in the regulation of gene expression from sets of promoter sequences controlling co-expressed genes. Next, the chapter by Samsonova et al. connects this issue of transcriptional regulation with that of the control of cell differentiation and pattern formation during embryonic development. Finally, H. de Jong and D. Thieffry review a series of mathematical approaches to model the dynamical behaviour of complex genetic regulatory networks. This contribution includes brief descriptions and references to successful applications of these approaches, including the work of B. Novak, on the dynamical modelling of cell cycle in different model organisms, from yeast to mammals.
. Provides a comprehensive overview of the structure and function of DNA and RNA at the interface between physics, biology and information science.
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About the Author
Simona Cocco's research activity since 2001 is devoted to the applications of statistical physics to biophysics. Her main contributions on the latter issue, in collaboration with Remi Monasson, are related to the modeling of single molecule experiments, in particular the structural transtitions of the DNA and RNA molecules under mechanical stress.
Remi Monasson's research activity since 1995 is devoted to the applications of statistical physics to interdisciplinary fields as computer science and biophysics. His main contributions on the latter issue, in collaboration with Simona Cocco, are related to the modeling of single molecule experiments, in particular the structural transitions of the DNA and RNA molecules under mechanical stress.
The research of Denis Thieffry focuses on the development of qualitative tools for the integration, the modeling and the dynamical analysis of biological regulatory networks. These tools are currently applied to the dynamical modeling of gene networks involved in development, cell cycle and cancer.
Jean Dalibard works in the field of atomic physics and quantum optics. His recent activities is centered on the physics of cold quantum gases, in particular Bose-Einstein condensation.
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Allgemeine Geschäftsbedingungen mit Kundeninformationen
Inhaltsverzeichnis
Geltungsbereich
Vertragsschluss
Widerrufsrecht
Preise und Zahlungsbedingungen
Liefer- und Versandbedingungen
Eigentumsvorbehalt
Mängelhaftung
Anwendbares Recht
Gerichtsstand
Alternative Streitbeilegung
- Geltungsbereich
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- Vertragsschluss
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2.5 Bei der Abgabe eines Angebots über das Online-Bestellformular des Verkäufers wird der Vertragstext vom Verkäufer gespeichert und dem Kunden nach Absendung seiner Bestellung nebst den vorliegenden AGB in Textform (z. B. E-Mail, Fax oder Brief) zugeschickt. Zusätzlich wird der Vertragstext bei ZVAB/Abebooks archiviert und kann vom Kunden über sein passwortgeschütztes Nutzerkonto bei ZVAB/Abebooks kostenlos abgerufen werden.
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- Liefer- und Versandbedingungen
5.1 Die Lieferung von Waren erfolgt auf dem Versandweg an die vom Kunden angegebene Lieferanschrift, sofern nichts anderes vereinbart ist. Bei der Abwicklung der Transaktion ist die in der Bestellabwicklung des Verkäufers angegebene Lieferanschrift maßgeblich.
5.2 Scheitert die Zustellung der Ware aus Gründen, die der Kunde zu vertreten hat, trägt der Kunde die dem Verkäufer hierdurch entstehenden angemessenen Kosten. Dies gilt im Hinblick auf die Kosten für die Hinsendung nicht, wenn der Kunde sein Widerrufsrecht wirksam ausübt. Für die Rücksendekosten gilt bei wirksamer Ausübung des Widerrufsrechts durch den Kunden die in der Widerrufsbelehrung des Verkäufers hierzu getroffene Regelung.
5.3 Der Verkäufer behält sich das Recht vor, im Falle nicht richtiger oder nicht ordnungsgemäßer Selbstbelieferung vom Vertrag zurückzutreten. Dies gilt nur für den Fall, dass die Nichtlieferung nicht vom Verkäufer zu vertreten ist und dieser mit der gebotenen Sorgfalt ein konkretes Deckungsgeschäft mit dem Zulieferer abgeschlossen hat. Der Verkäufer wird alle zumutbaren Anstrengungen unternehmen, um die Ware zu beschaffen. Im Falle der Nichtverfügbarkeit oder der nur teilweisen Verfügbarkeit der Ware wird der Kunde unverzüglich informiert und die Gegenleistung unverzüglich erstattet.
5.4 Selbstabholung ist aus logistischen Gründen nicht möglich.
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Eigentumsvorbehalt
Tritt der Verkäufer in Vorleistung, behält er sich bis zur vollständigen Bezahlung des geschuldeten Kaufpreises das Eigentum an der gelieferten Ware vor. -
Mängelhaftung
Soweit sich aus den nachfolgenden Regelungen nichts anderes ergibt, gelten die Vorschriften der gesetzlichen Mängelhaftung. Hiervon abweichend gilt bei Verträgen zur Lieferung von Waren:
7.1 Handelt der Kunde als Unternehmer,
hat der Verkäufer die Wahl der Art der Nacherfüllung;
beträgt bei neuen Waren die Verjährungsfrist für Mängelrechte ein Jahr ab Ablieferung der Ware;
sind bei gebrauchten Waren die Mängelrechte ausgeschlossen;
beginnt die Verjährung nicht erneut, wenn im Rahmen der Mängelhaftung eine Ersatzlieferung erfolgt.
7.2 Die vorstehend geregelten Haftungsbeschränkungen und Fristverkürzungen gelten nicht
für Schadensersatz- und Aufwendungsersatzansprüche des Kunden,
für den Fall, dass der Verkäufer den Mangel arglistig verschwiegen hat,
für Waren, die entsprechend ihrer üblichen Verwendungsweise für ein Bauwerk verwendet worden sind und dessen Mangelhaftigkeit verursacht haben,
für eine ggf. bestehende Verpflichtung des Verkäufers zur Bereitstellung von Aktualisierungen für digitale Produkte, bei Verträgen zur Lieferung von Waren mit digitalen Elementen.
7.3 Darüber hinaus gilt für Unternehmer, dass die gesetzlichen Verjährungsfristen für einen ggf. bestehenden gesetzlichen Rückgriffsanspruch unberührt bleiben.
7.4 Handelt der Kunde als Kaufmann i.S.d. § 1 HGB, trifft ihn die kaufmännische Untersuchungs- und Rügepflicht gemäß § 377 HGB. Unterlässt der Kunde die dort geregelten Anzeigepflichten, gilt die Ware als genehmigt.
7.5 Handelt der Kunde als Verbraucher, so wird er gebeten, angelieferte Waren mit offensichtlichen Transportschäden bei dem Zusteller zu reklamieren und den Verkäufer hiervon in Kenntnis zu setzen. Kommt der Kunde dem nicht nach, hat dies keinerlei Auswirkungen auf seine gesetzlichen oder vertraglichen Mängelansprüche.
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Anwendbares Recht
Für sämtliche Rechtsbeziehungen der Parteien gilt das Recht der Bundesrepublik Deutschland unter Ausschluss der Gesetze über den internationalen Kauf beweglicher Waren. Bei Verbrauchern gilt diese Rechtswahl nur insoweit, als nicht der gewährte Schutz durch zwingende Bestimmungen des Rechts des Staates, in dem der Verbraucher seinen gewöhnlichen Aufenthalt hat, entzogen wird. -
Gerichtsstand
Handelt der Kunde als Kaufmann, juristische Person des öffentlichen Rechts oder öffentlich-rechtliches Sondervermögen mit Sitz im Hoheitsgebiet der Bundesrepublik Deutschland, ist ausschließlicher Gerichtsstand für alle Streitigkeiten aus diesem Vertrag der Geschäftssitz des Verkäufers. Hat der Kunde seinen Sitz außerhalb des Hoheitsgebiets der Bundesrepublik Deutschland, so ist der Geschäftssitz des Verkäufers ausschließlicher Gerichtsstand für alle Streitigkeiten aus diesem Vertrag, wenn der Vertrag oder Ansprüche aus dem Vertrag der beruflichen oder gewerblichen Tätigkeit des Kunden zugerechnet werden können. Der Verkäufer ist in den vorstehenden Fällen jedoch in jedem Fall berechtigt, das Gericht am Sitz des Kunden anzurufen. -
Alternative Streitbeilegung
Der Verkäufer ist zur Teilnahme an einem Streitbeilegungsverfahren vor einer Verbraucherschlichtungsstelle weder verpflichtet noch bereit.
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